По вашей ситуации в два этапа:
Итак, дом, собственником доли которого является несовершеннолетний, вы продать можете, но(!) только при наличии разрешения органов опеки и попечительства. Они его с радостью дадут, если целью продажи является улучшение жилищных условий. Т.е. доля в доме и участке в другом регионе должна быть больше/лучше.
Теперь о материнском капитале для покупки встречного жилья. Выделить доли только детям у вас не выйдет, материнский капитал расходуется на улучшение условий проживания всех членов семьи и никак иначе. Так что наличие долей у вас и мужа обязательно.
Вернёмся к согласованию продажи дома. Будет ли улучшением доля для ребенка в новом доме, если большая площадь будет поделена на 4 части?
Поэтому прямо так ситуацию не решить. Возможно оформить для попечительства нотариальное обещание наделить детей долями после продажи в течении какого-то времени, деньги вырученные с продажи положить на счет сына (согласно его доли), а затем только покупать с использованием средств мат.капитала, согласовав деньги вырученные с продажи доли сына потратить на покупку нового дома.
Ваша сделка сложная весьма, советую обратиться к профессионалу, оформив доверенность на сбор всех справок без права продажи. Это и время сэкономит, и нервы.