Если работник принят на время отпуска основного работника, то он должен быть уволен в связи с выходом основного работника. Точка.
Но, если у работодателя есть вакантное место, то он может приказом перевести "временного"
работника на постоянное место работы. Но все документы нужно подготовить до окончания срока
временной работы. Если позже, то придется сначала увольнять работника. Потом он пишет заявление
с просьбой принять на работу на такую-то должность. И далее Вы оформляете его на эту
должность. То есть не перевод, а принятие на работу. Ну и новый трудовой договор.
Если сделать это до окончания срока "временной работы", то:
Во-первых, работник пишет заявление о переводе на постоянное место работы с такого-то числа (которым заканчивается "временная работа").
Далее Вы выдаете приказ о переводе на постоянное место работы, где указываете период его временной работы, срок окончания, заключения и номер трудового договора.
Составление бессрочного трудового договора. Никаких дополнений. Только новый. Один - в бухгалтерию, другой - работнику.
Дальше - запись в трудовой книжке о переводе на постоянную работу. Номер приказа. Ознакомить работника с записью под подпись.
Дальше - новая должностная инструкция для работника.