Крик - признак слабости прежде всего. Это сигнал к тому, что что-то начальника беспокоит, раз он не может сдержать эмоции, возможно, у него какие-то проблемы. И ему завидно, что у вас этих проблем нет. Причины крика могут быть разными:
1) наорал на него его начальник. Прилюдно. На каком нибудь совещании. Или на ковер вызвал к себе в кабинет, унизил.
2) Совещания. На них начальству регулярно выносят мозги. И ему куда-то надо деть напряжение, негативные эмоции. А тут вы под рукой.
3) Зарплата. Часто, особенно в бюджетной сфере, зарплата у начальства низкая. Да, она выше тысячи на три-четыре, чем у остальных подчиненных. Но обязанностей он выполняет больше, плюс первые два пункта.
4) Домашние проблемы.
5) Плохое самочувствие, болячки
6) "Переходный" возраст, психологические проблемы (неврастения, психопатия и т.п)
7) Он плохо знает свою специализацию, некомпетентен (особенно это касается молодых начальников, которые по блату руководят компаниями). Он пока еще сам где-то учится. А раз позицию свою аргументировать не может, переходит на крик.
8) Считает всех отбросами, просто зазнался. Он один "барин", а вы - "крепостные".
9) На предыдущей работе его выгнали. И он специально пришел сюда работать начальником. Ему помнится ситуация и он самоутверждается, отыгрывается на вас.
Вообще, начальник - живой человек. Его надо аккуратно пожалеть, выяснив причину крика, вывести осторожно в другое помещение, пройтись по коридору до столовой, кофейной, медпункта. А потом попытаться поговорить спокойно. Крик исчезнет. Проверено.