Если человек "хорошо защищенный юридически", как Вы выразились, то он свои права знает. И уволить его как "плохого работника" - это надо постараться.
У нас был похожий случай.
Поймали за опоздание 5 минут (всеобщая проверка была по утрам, все опоздавшие выговоры получили), потом за прогул (с утра, вроде отпросилась на несколько часов, но у кого - не вспомнила).
А еще комиссионно акт составили о невыполнении рабочего задания (коммунальное предприятие, жалоба не проверена вовремя).
Подготовили приказ об увольнении. Наша юрист объяснила, что для увольнения "по инициативе администрации" надо три однотипных нарушения (а не всего три). То есть,
У нас в коллективном договоре был раздел
Там о графике работы, в т.ч. и начало/окончание рабочего дня и время перерыва (кстати, перед перерывом и после него у нас тоже "ловили опоздавших"). А также об ответственности за нарушение трудовой дисциплины.
Должностные обязанности отражаются в Положении о предприятии/организации или/и в должностной инструкции.
В наши инструкции благоразумно был включен пункт "выполнять разовые задания руководства".
С одной стороны, под этот пункт легче всего подвести нарушение со стороны работника. А с другой стороны - надо грамотно обосновать, что именно это задание было поручено, работник проинструктирован, как его выполнить, а он что-то не сделал, или сделал не так.
Доказательством невыполнения работы или праздного шатания в рабочее время:
может являться хронометраж рабочего времени.
Мы иногда сами заполняли бланки с указанием периода времени и выполняемой работы. Хорошо видно, кто что делает, а кто мешает всем.
Потом по поручению руководителя хронометраж проводили и наши экономисты или отдел кадров. Весь рабочий день они находились в каком-то подразделении, записывая поминутно, кто что делает.
Нужно знать, есть ли в Вашей фирме коллективный договор или трудовые договора с работниками. Есть ли должностные инструкции или др. документ (не листик на стене или файл в компьютере), и что там говорится об обязанностях конкретного работника.
Остается найти в этих документах пункт, который данный работник нарушает. И составить акт/протокол о нарушении.