Оба варианта являются допустимыми.
Для того, чтобы понять, как слово пишется в конкретном случае, нужно рассмотреть контекст предложения.
Прежде всего обозначим, что "работающий" - это причастие, образованное от соответствующего глагола "работать".
По общим правилам русского языка частица "не" с причастиями может применяться как слитно, так и раздельно.
1) Слитно, если нет пояснительных слов.
2) Раздельно, если они есть.
Пример 1.
Временно не работающий компьютер поставили на полку в кладовке.
Здесь "временно" выступает в качестве пояснительного слова, следовательно, написание будет раздельным.
Но. Если причастие становится субстантивированным (т.е.переходит в разряд существительного), то "не" пишется слитно.
Пример 2: Статус Петрова был указан в анкете как временно неработающий.
Из справочника по орфографии и пунктуации Д.Э. Розенталя: