Микроволновка может обеспечить разную температуру разогрева, это сложно определить.
Кристаллизованный мед следует разогревать при невысокой температуре.
Мед теряет свою биологическую ценность, если его разогревать при высоких температурах, но менее слаще от этого он не станет, а опасным и вредным он после разогрева не будет.
Поэтому употребляйте его, как лакомство, для выпечки, там же мед тоже подвергается нагреву, при чем, до гораздо более высоких температур. На будущее ориентируйтесь на температуру около 40 градусов, не выше.
Так что разогрев в микроволновке мед вредным не сделает, просто его полезные качества могут пострадать, не более того.
Хотя кто-то вообще считает разогрев продуктов в микроволновке, использование микроволновки опасным из-за микро-волн. Вопрос до сих пор спорный, тут уж каждый решает сам.
Мед же можно разогревать и на водяной бане.