Наилучший материал посудины, в которой вы собрались хранить святую воду (впрочем, это касается и обычной воды) - прозрачное стекло. И, как бы это ни было странно, сосуд лучше ставить не в темное место, а туда, где есть рассеянный свет.
Посудину можно накрыть крышкой, тарелкой, материей и т.д., лишь бы вода не загрязнилась за счет внешних обстоятельств (например, пыли), сама же по себе святая вода если и портится, то крайне редко.
Не рекомендуется хранить святую воду в непосредственной близости от пищевых продуктов.
Если все-таки вода испортилась, не выливайте ее в унитаз или раковину, лучше вылить ее в природный источник, например, реку, ручей, озеро и т.д.