О.. Эта тема так запутана и сложна...
Эта рекомендация пошла со времен Ni-Cd и Ni-Mh аккумуляторов, которые как правило чаще всего заряжались тупо по времени (в редких случаях по методу "дельта V", но и он не всегда срабатывал). И соответственно чрезмерно долгая зарядка сокращала срок службы - обычно нужно было следить за этим самому. Кроме того, нужно было (не обязательно, но желательно) заряжать лишь после полной разрядки, иначе появлялся эффект памяти и емкость снижалась (это касалось Ni-Cd в большей степени, и Ni-Mh в меньшей).
В современных же устройствах используются аккумуляторы совершенно иного типа, литиевые (li-ion или li-pol). Они кардинально отличаются. Из нельзя перезаряжать - это грозит не просто выходом из строя, но и возгоранием и самоуничтожением аккумулятора. Их нельзя чрезмерно разряжать - это грозит выходом из строя. К чему привели эти требования? К тому что аккумулятор очень жестко контролируется электроникой, которая не может позволить ему перезарядится. Не может! Никогда в жизни! Более того, в самом аккумуляторе стоит второй порог электронной защиты от перезарядки (правда уже аварийной, на случай если телефон забарахлит). В этих аккумуляторах нет эффекта памяти. Точнее он есть, но настолько незначительный, что мы его не рассматриваем. По этому заряжать можно когда угодно, и сколько угодно, производитель позаботился о работе в любых режимах. Единственное, в случае частых рваных циклов не полной зарядки, рекомендуется иногда время от времени всё-же делать полный глубокий цикл разряда-заряда, чтобы освежить так сказать аккумулятор и его контролирующие мозги.
Из всего написанного следует, что никаких проблем быть не может. Но! Есть еще одна, и вот тут начинается путаница. Под названием ограниченный срок службы. Малый срок службы литиевого аккумулятора и без того зависит еще и от уровня его максимального заряда. В идеале - половинный заряд и прохлада сберегут аккумулятор. Чем ближе приближаемся к отметке 100% заряда, тем быстрее сажаем его срок службы. Производителям не интересно ограничивать заряд до 90% и беречь тем самым аккумулятор - такого в нашей экономике не будет, кроме того всем хочется больше емкости и чаще уж тогда менять телефоны. Кстати, иногда такой режим бережного отношения к аккумулятору присутствует, например в некоторых ноутбуках.
Ладно, я не об этом. А о принципе зарядки (можете открыть википедию, почитать статью на эту тему подробнее).
Вот лежит телефон долго на зарядке. Как обычно происходит? Аккумулятор зарядился полностью, отключилась зарядка. Проходит 10 минут, аккумулятор чуток разряжается, и снова пошел процесс дозарядки (обычно даже не отображаемый индикатором зарядки, такой процесс обычно невидим для пользователя, т.к. аккумулятор в общем-то и так заряжен) до 100%. И так далее циклами он чуток разряжается-заряжается. И всё бы ничего, но он постоянно добивается на все 100%, что не очень позитивно влияет на срок службы. Вот и ответ. Перезарядить то нельзя, но и держать постоянно на полном заряде - возможно, не самый лучший для аккумулятора режим, быстрее убивающий его. Хотя - это штатный режим, и он более чем допустим. А что говорить о сроке службы... ну, если очень дорог аккумулятор (замены нет) - можете и заморачиваться с наблюдением за зарядкой, а если технику всё равно будете потом менять - то не всё ли равно, чуть меньше или чуть дольше он будет жить? Несмотря ни на что, я бы всё же советовал не думать о всех тонкостях и заряжать ровно тогда и ровно столько, на сколько вам это будет удобно. Имхо, не стоит аккумулятор того, чтобы вы за ним ухаживали как за тамагочей - у нас и так забот полно. И современная техника рассчитана на любые извращения с зарядкой. А для телефонов, если что, в каждом сотовом ларьке продают новые аккумуляторы за разумные деньги (правда, не всегда хорошие).