Если цель уменьшительно-ласкательно обозначить болезнетворное начало, то варианты, предложенные ivaksto, подойдут как нельзя лучше, при этом хрипотца вкупе с придыханием может появиться непроизвольно под воздействием этих самых микробушков, бациллушек и вирусятинок.
Если же требуется как-то ласково обратиться к не очень приятному, или даже прямо сказать, вредному человеку, то придется искать другие варианты. Например, так: "Ути, моя заразушка!" Или вот эдак: "Вот ведь заразенок мелкий!"
Вспоминая прочие уменьшительно-ласкательные суффиксы, используемые в русском языке, можно напридумывать и такие словечки: заразочка, заразик, заразенчик, заразенушка. На этом моя фантазия иссякла, извините...
Ну а что касается интонации, то она, в зависимости от испытываемых в данный конкретный момент эмоций и личного отношения к заразе, может быть какой угодно. Можно произносить эти слова тихо и даже с некоторой нежностью, а можно очень экспрессивно, используя по максимуму силу своего голоса.