Обращение к местной администрации вряд ли решит проблему - это не ее компетенция. Да и прокуратура не должна заниматься такими вопросами, если речь не идет об угрозе жизни людей, которая возникла в результате функционирования этой станции.
Решение вопроса зависит от того, на чьем балансе находится железная дорога, на которой расположена станция, которую Вы хотите переместить в другое место. Тут может быть 2 варианта.
Если железная дорога магистральная, то станция находится на балансе ОАО"РЖД", соответственно, все вопросы по этой станции решает руководство ОАО "РЖД". Второй вариант - станция грузовая и относится к промышленному железнодорожному транспорту (ППЖТ), находится на его путях, но это, похоже, не Ваш вариант.
И вообще я не уверена, что Вы недовольны местом расположения железнодорожной станции, может быть Вы считаете, что не на том месте расположен железнодорожный вокзал?
В принципе, если ваше предложение покажется выгодным руководству железной дороги, оно может его рассмотреть и направить свои предложения руководству ОАО "РЖД", так что для начала обратитесь в письменном виде к руководству вашей железной дороги или же сразу в ОАО "РЖД". можно сразу в оба адреса. Подписи в поддержку Вашего начинания, включая поддержку местной администрации, лишними не будут.
Есть еще такой вариант - поднятие вопроса через СМИ (средства массовой информации), то есть написать письмо в газету, например, в "Гудок" или задать волнующий вас вопрос кому-нибудь из компетентных лиц в прямом эфире.
И последнее - а Вы уверены, что никто не рассматривал эту проблему до вас? Может быть, интересующий Вас объект уже занесен в перспективные планы развития региона?