Вопрос хороший. Действительно, в организме же живут условно-патогенные и сапрофитные микроорганизмы, которые даже помогают человеку. Но когда в тот же кишечник внедряются агрессивные болезнетворные (патогенные) микроорганизмы, то "своей" микрофлоре приходится "потесниться" и уступить место "захватчикам".
Так откуда же эти патогенные микроорганизмы берутся?
Прежде всего, они вводятся в организм человека с испорченными продуктами питания и некачественной водой. Водный фактор вообще может приводить к огромным вспышкам и даже эпидемиям инфекционного заболевания, когда болеют и взрослые, и дети. Вот так болели раньше холерой, брюшным тифом - именно с плохой водой возбудители проникали в организмы людей, заражая их. Связанными с водой могут быть вспышки дизентерии, вирусного гепатита А - это тоже кишечные инфекции.
Очень часто патогенные возбудители попадают в организм в пищей. Это могут быть готовые блюда, которые неправильно или слишком долго хранились (заправленные салаты, винегрет, холодец, сосиски и сардельки, молочные продукты, зельц, торты и пирожные и так далее).
А могут быть полуфабрикаты, фарш, субпродукты, которые также неправильно хранились.
Таким образом люди заражаются сальмонеллезом, дизентерией, другими кишечными инфекциями.
А есть и еще один путь заражения - человек может заразиться при тесном общении с больным, уходе за ним, кормлении, особенно если при этом он плохо моет руки.
Микроорганизмы могут оставаться на посуде, полотенце, постельном белье, мебели, дверных ручках от больного, а также могут переноситься мухами.