Оглавление Вашей курсовой или дипломной работы - это план, по которому Вы работаете, именно поэтому его нужно составить в самом начале над работой.
Перед Вами стоит некая проблема, которую ещё никто не пытался разрешить или делал это мало, неохотно и без ответов на самые важные вопросы. Это актуальность Вашей курсовой. Вы собираетесь исследовать эту проблему, проведя исследования (какие?) материала (какого?), используя определённые методы (какие?). Это цели и методы Вашей курсовой. Всё это следует указать во введении.
Дальше начинается собственно Ваше научное исследование. Каждая глава - это рассказ о каждом конкретном исследовании, проведённом Вами. Независимо от того, к каким результатам привёл каждый опыт или каждое исследование, описание идёт по схеме: взяли это - рассмотрели так-то - обнаружили то-то и то-то. То есть сначала Вы проводите исследования и составляете записки об их прохождении, а затем из количества этих уже проведённых исследований составляется количество глав. Их не может быть двадцать, даже в докторской диссертации. От одной до трёх обычно.
Когда все намеченные исследования проведены и результаты этих малых исследований собраны, самое время обобщить их, нарисовать бóльшую картину, чем солянка из отдельных исследований или опытов. Самое время вспомнить, что именно требовало выяснения, и описать, какой свет пролит на эту проблему в результате Ваших трудов. Всё это описывается в выводах.
Точно так же будет выглядеть Ваша дипломная, с той лишь разницей, что каждой главой в ней станет бывшая дипломная. И если дело дойдёт до диссертаций, то писаться они будут по точно такому же принципу.
Работа в любом случае идёт по такой схеме: поставить себе задачу - выполнить намеченное - описать проделанное. Введение курсовой пишется до того, как Вы приступили изучать намеченное, при этом план курсовой - это Ваш план работ. Каждая из глав пишется либо по мере продвижения по плану, либо тогда, когда все исследования уже завершены.
Всё это должен был объяснить Вам научный руководитель. Взять за ручку и рассказать. Если он не взял Вас за ручку, схватите его за горло (фигурально выражаясь) и скажите, что Вы за деревьями лес потеряли, пусть прорубит столбовую дорогу.