Почему-почему...
По традиции.
Точнее, по суеверной традиции.
Не скажу точно об окнах - а вот под порогом входной двери в глубокой древности хоронили предка.
Зачем?
Для охраны дома от враждебных сил.
Потому на пороге не сидят, в дом (через порог) без приглашения не входят - поскольку мертвый дедушка только и ждет чужака, чтобы его убить или, как минимум, повредить ему.
Кстати, отсюда же перенесение через порог невесты - она пока еще посторонняя, ее нужно вначале представить предкам.
Отсюда же - в дом первым пускали животное, кошку... первоначально - старика, которого не жалко. Это ж жертва духам жилища!
Соответственно, и не разговаривают через порог, и не здороваются. Это барьер между домом и окружающим. И предку неуважение, и разговаривающим через порог вред.
Собственно, поэтому.
Как обычно с суевериями: причины давно забились, а поверье осталось.
С окнами, подозреваю, похоже, но чуть иначе: если кричать в окна, вы показываете враждебным духам снаружи, что тут - есть проход в дом. Дверь защищена лучше всего, окна - хуже. Дедушка там не похоронен, оттого пространство вокруг окон сплошь покрывалось оберегами. Сейчас это просто наличники- "для красоты", с "просто картинками" вместо четких символов-оберегов.
Ну и разговаривать через окно нельзя все потому же: потому, что дальние предки не разговаривали, чтобы не показать вход в дом через окно кому не следует.
А вам нельзя разговаривать через окно и дверь - потому, что вы современный человек, бездумно следующий бездумно усвоенной суеверной традиции...
Вот как-то так.