Чтобы разбираться во втором философском слое эпопеи "Дюна", необходимо иметь достаточно хорошее образование по истории, разбираться в политике, а так же быть не чуждым философии.
Кроме верхнего приключенческого слоя, вся серия книг "Дюна" содержит глубокий смысл, подобный эпопее Айзека Азимова "Академия".
Но если "Академию" даже сам Фурсов советует читать(а это очень, ну очень образованный человек), то "Дюна" незаслуженно обойдена стороной.
Там видят только мистическую и приключенческую сторону.
Император хотел устранить Атрейдиса по той же самой причине, по которой у нас в России сейчас устраняют из власти любого честного человека с понятиями о Долге перед народом.
Такой человек очень сильно оттеняет все недостатки правителей, не обладающих той же долей благородства к своим подданным.
Такие люди - это сами по себе знамя для борьбы за Будущее человечества.
К тому же Атрейдес имел право как один из ближайших мужских родственников Императора на престол, если б согласился жениться на его дочери. Именно по этой причине Джессика согласилась остаться наложницей для Лето, хотя могла методами воздействия Бене Гессерит(организации практикующих заговорщиц с паранормальными способностями) сделать то, что она бы пожелала.
Лето должен был оставаться свободным как знамя для возможного антиправительственно<wbr />го бунта.
Харконенны же в народе вызывали столько же восторга, сколько и Чубайс и потому были императору не опасны. При этом открыто Император не мог высказывать им поддержки, т.к. этим навлек бы и на себя часть ненависти. В общем, старайтесь рассмотреть те события через призму современных. Фрэнк Герберт - очень одаренный философ.