Смотря что Вы считаете беспорядком.
Есть беспорядок, когда маршрутки грубо нарушают различные правила, начиная с ПДД. В принципе, волей властей это лечится. Устраиваются спецоперации, предпринимателей штрафуют. Таким образом действительно можно постепенно побороть убитый (опасный) подвижной состав, перегрузы, шумахерство. Есть города с накопленным положительным опытом такой борьбы - например, Саранск (хоть и у нас не всё идеально).
В то же время и само существование маршруток как основного, а не вспомогательного транспорта можно считать беспорядком. Но это уже от бедности. Всякие спринтеры едят очень мало топлива. Пазики едят много (почти как нормальный автобус), зато чинятся кувалдой. Этот беспорядок можно победить лишь устойчивым экономическим ростом.
Еще один беспорядок - невыдача билетов... но эту тему всякие урбанисты раздувают. По большому счету это не уход от налогов, как они ошибочно считают, ибо налоги у маршрутчиков в основном по системе ЕНВД или патента. То есть примерно как у торговцев на рынке, которые тоже не особо выдают кассовые чеки, да и кассовых аппаратов нередко не имеют. И, по большому счету, голубая мечта некоторых людей про полный безнал и т. п. есть путь к тоталитарной среде (ну, это чисто мое мнение). При тоталитарной среде мы уже достаточно пожили.
