Бабушки всегда балуют своих внуков и считается что и любят они внуков больше, чем детей. С этим нужно смириться. Постарайтесь мирно поговорить с бабушкой, попытайтесь донести до нее, что таким образом она делает "медвежью" услугу, только разговор этот должен быть ни в коем случае ни в обвинительной форме, а как будто вы у нее просите совета, ведь пожилые люди так любят, когда к ним обращаются за советом, а не "воспитывают". Не разграничивайте "мой сын - ваш внук", говорите "наш ребенок" - и попытайтесь сформулировать проблему, затем спросите, "Мама, как ты считаешь наш малыш то то и то то..." Попытайтесь из мамы сделать союзника, а не конкурента, можно спросить, как бы она поступила, если бы вы в детстве вели себя так же, как теперь ваш сын.
С другой стороны, постарайтесь больше общаться со своим ребенком, вечерами, вместо того, чтоб сидеть дома и общаться с бабушкой, сходите вдвоем с сыном погулять, отдохнуть, пусть у вас с сыном будут свои маленькие тайны, дети это очень любят и ваш авторитет в глазах сына только повысится. И ни в коем случае ребенок не должен видеть ваших с мамой выяснения отношений, он всегда займет позицию более сильного, так как в нем он видит опору.
Отвечая на ваш вопрос, мне пришла в головы мысль о книге Павел Санаев "Похороните меня за плинтусом", почитайте ее, я думаю, что вы многое поймете. Удачи вам и терпения в налаживании отношений.