Конфликт подчиненного с начальником, как правило, неизбежен.
Во-первых, потому, что вы с ним изначально имеете разный статус и разные задачи. Как правило, руководитель хочет поменьше заплатить и побольше получить работы, причём безупречного качества. В свою очередь, сотрудник хочет получить побольше денег и затратить при этом минимум усилий. Похоже на конфликт интересов.
Во-вторых, потому, что часто работу бывает невозможно выполнять безупречно. Даже супер-специалисты иногда допускают ошибки, и не всякий руководитель готов их прощать.
В-третьих, потому, что над вашим начальником часто стоит вышестоящий босс, перед которым он отчитывается. Из-за этого ваш руководитель вынужден спрашивать с вас работу, не всегда считаясь с вашими интересами. Кроме того, некоторые боссы бывают педантичны по натуре - они тоже люди, со своими достоинствами и недостатками.
В-четвёртых, никто не отменял случаев мошенничества, дурных порядков в организациях, плохой совместимости людей между собой. Если шеф задумал заставить вас потрудиться без оплаты, вряд ли вы захотите ему это легко простить и оставить это без ответа. Если вы с шефом ненавидите друг друга (бывает всякое), то вряд ли ваше взаимодействие обойдётся без конфликтов.
Можно, конечно, попробовать снизить риски (работать если с минимумом ошибок, соблюдать дресс-код и быть дипломатичным человеком), но вряд ли удастся избежать конфликтов совсем. Тут я бы поставила вопрос так: Как минимизировать последствия конфликтов с начальством?