Vlad38,
позвольте, пожалуйста, внести уточнения в ваш вопрос:
1) мысль - это не слова в голове, а внутренний импульс,
2) непосредственно, минуя слова, реализующийся в действие.
3) Молитва может вытеснить одну говорильню другой, но не обязательно очищает помыслы.
4)Важна не сама молитва, а то, как молящийся ее воспроизводит
Поэтому искоренять надо не плохие разговоры в голове,
а корешки, откуда они растут:
для этого одной молитвы не достаточно, а требуется большая работа над собой.
Во все времена это называлось покаянием,
но не в смысле самообвинения, а в смысле самоосознания своего греха и последующего очищения, освобождения от него.