Разница есть, и обусловлена эта разница различными значениями данных слов.
Прилагательное вездесущий употребляется только с существительными одушевлёнными, так как, с одной стороны, это постоянный эпитет Бога (в христианстве) со значением
с другой – именно так называют людей, способных в течение короткого времени побывать с нескольких местах, сделать многое либо суют свой нос во многие дела, чаще всего их не касающиеся. К примеру, вездесущими часто называют журналистов – и не случайно: журналиста, как и волка, ноги кормят.
Лексемы насущный и существенный согласуются с существительными неодушевлёнными, причём само значение слова «насущный» – показатель того, что оно ограничено в употреблении. Насущный – значит тот, который имеет важное значение для жизни, является жизненно необходимым, таким, без которого не обойтись. Чаще всего лексема «насущный» употребляется со словами ХЛЕБ, ВОПРОС, ЗАДАЧИ, ПОТРЕБНОСТИ, то есть словосочетания с ним – это в основном фразеологизмы, точнее, фразеологические сочетания.
Существенный – это значительный, очень важный, составляющий сущность чего-то, являющегося неодушевлённым. Лексема эта согласуется со многими существительными, среди которых, например, такие как ПРИЗНАК, НЕДОСТАТОК, НЕДОРАБОТКА, ЧЕРТА, РАЗНИЦА, РАЗЛИЧИЕ, ПОНЯТИЕ, ПОВРЕЖДЕНИЕ, ДОПОЛНЕНИЕ, ЗАМЕЧАНИЕ, ИЗМЕНЕНИЕ, УЛУЧШЕНИЕ.
Пожалуй, единственное слово, употребляющееся с обоими этими прилагательными, – ВОПРОС: насущный вопрос и существенный вопрос. Но значения у этих словосочетаний, естественно, разные: 1) жизненно важный вопрос; 2) важный вопрос.