Если брать в пример современную баню, состоящую из парной, помывочной и предбанника, то для каждого из этих помещений ситуация с обработкой вагонки разная. Более того, вопрос очень спорный и мнений касаемо него привеликое множество, поэтому я поведаю, как поступил у себя в бане и поясню, почему.
Начну с парной. Стены и потолок я зашил осиновой вагонкой и не обрабатывал ничем. Решение это было принято после следующих умозаключений: температура в парной доходит до 100 градусов и выше и неизвестно доподлинно, что вам продали качественную пропитку и вы не нанесете вред своему здоровью. Второй момент опять же связан с высокой температурой внутри парной и, как следствие, низкой вероятностью образования грибка и прочих организмов на поверхностях и в структуре стен и потолка. Третье: парная должна "дышать", а многие пропитки этому препятствуют. Однако, прошу заметить, полок в парной я все-таки покрыл в местах соприкосновения с телом маслом для полка кистью в 2 слоя (второй слой нанес примерно через час после первого).
С прихожей и помывочной дела обстоят попроще. Причем в прихожей, как правило прохладно, поэтому я использовал более бюджетный вариант - сосновую вагонку, которая "заплачет" в парной и помывочной. Учитывая, что в помывочной довольно высокая влажность, особенно внизу, то я нанес на вагонку кистью в два слоя антисептик "Сенеж сауна". В прихожей прошелся тем же сенежем один раз и считаю это достаточным.
Повторюсь, вопрос неоднозначный, я лишь изложил свою позицию, а конечный выбор, разумеется, за вами! С легким паром!