Если сильно упрощенно, то шея, да и всё тело, болит от неприспособленности человека к такому виду работы. Вы сидите практически неподвижно, а голова, так вообще неподвижно смотрит на экран монитора под определенным углом, потому что "картинка" должны быть в центре зрения. Монитор неподвижен, значит и голова зафиксирована вниманием! Кроме шейных мышц, есть еще мышцы скелетные, которые работают совсем по другому и им нужно несколько (иногда много) минут на перестройку. А наш организм изначально настроен на физическую подвижность и "непрерывное верчение головой" (утрировано).
К сожалению, у нынешних мониторов до сих пор нет оперативной перестройки положения экрана. Так что вам придется самому "перестраиваться" около монитора. Меняйте положение, особенно наклон головы (вверх-вниз), делайте перерывы. Если вы уже сейчас чувствуете некомфорт, то это серьезный сигнал, что организму неудобно! Если сейчас этот сигнал проигнорировать, то в будущем возможно серьезные последствия. Не надо надеяться на авось. Ну и для глаз тоже делайте перерывы, зарядку.
Кто-то может часами сидеть неподвижно, а кто-то минуты не просидит спокойно. Этот "стиль жизни" заложен в наших генах. У кого-то организм приспособлен к долгому и тихому сидению в засаде на охоте, а кто-то всю жизнь бегал. И вот эта "генетическая программа физического поведения" храниться в нас тысячи лет. Не надо идти поперек своей природы, надо чутко прислушиваться в её предпочтениям.