Начнём с того, что реально мы всегда пьём воду, содержащую то или иное количество растворенных веществ (чаще всего речь идёт о солях). Многие из этих растворённых солей нужны нашему организму. Можно тем или иным способом получить практически химически чистую воду, т.е. в которой кроме молекул воды ничего нет. Чаще всего близкую к такой воду получают перегонкой (дистилляцией), поэтому такую воду называют дистиллированной, и я буду так называть, независимо от того, каким образом она получена. Можно получить такую воду химическим путём ("ионным обменом"), обрабатывая её ионообменными смолами, или чисто физически, путем "обратного осмоса". Многие из имеющихся в продаже бытовых "фильтров" используют один из этих принципов, т.е. дают нам практически "дистиллированную воду", или близкую к таковой. Многочисленные исследования медиков свидетельствуют, что длительное употребление дистиллированной воды вредно для организма. Поскольку я не медик, не буду распространяться, чем именно вредно, при желании Вы можете сами найти интересующие материалы просто задав в любом поисковике (Яндексе, Гугле) вопрос "Вредно ли пить дистиллированную воду?".
Итак, в любой природной воде растворены какие-то соли. При нагревании некоторых солей с ними могут происходить какие-то химические превращения. В данном случае образование осадка связано с превращением бикарбонатов в карбонаты. Для упрощения рассмотрим бикарбонат кальция Са(НСО3)2. При нагревании (даже при кипячении) он разлагается на карбонат кальция и, воду и углекислый газ: Са(НСО3)2 -----> СаСО3 + Н2О + СО2. Карбонат кальция очень плохо растворим в воде (очень мало). Бикарбонат кальция тоже довольно плохо растворим в воде, но гораздо лучше (в большем количестве), чем карбонат кальция. Поэтому, лишний карбонат кальция выпадает в осадок (образует муть, плёнку на поверхности воды или образует "накипь".
Теперь отвечаю на Ваш конкретный вопрос: Это ни хорошо, ни плохо. Выпавший осадок осядет и он вас никак не касается. Если бы Вы, не дождавшись, пока он осядет, выпили его вместе с водой, то тоже ничего страшного. Если бы Вы не кипятили воду, тот выпили бы эту соль в виде бикарбоната. В желудке кислая среда и в любом случае и карбонат, и бикарбонат "растворятся", вернее превратятся в хлорид кальция. Часть его усвоится организмом, часть выйдет с калом, во всяком случае ничего вредного не произойдёт.
Аналогично бикарбонату кальция ведут себя и многие соли многовалентных металлов (кальция, бария, железа, меди и др.), чаще всего в воде могут быть соли магния и железа. Соли одновалентных металлов (натрия, калия, а также аммония, хоть он и не металл), хорошо растворимы в воде и в осадок не выпадают.