Рассада ,обычно, вытягивается от недостатка света и чрезмерного тепла. Можно при пикировке сажать углубляя стебелек растения. На нем пойдут новые корешки и растение будет крепче и толще. Помидоры вообще отлично дают корни. Даже если пасынок прикопать во влажную землю или просто в воду поставить - он даст корни и вырастет полноценное растение. Позже уже можно будет закалять рассаду, чтобы она уже не тянулась выше.
У меня рассада помидор растёт в специальных рассадниках на подоконнике. Первое закаливание томатов провожу тогда, когда на улице начинается потепление (от +15 градусов). Сначала вытянувшуюся рассаду привязываю к палочкам. Затем хорошо поливаю почву в рассаднике.Первое закаливание произвожу вечером, после 17 часов, чтобы не было яркого жгучего солнца, иначе рассада может сгореть. Через 3-4 часа заношу рассаду в теплицу или опять домой на подоконник. В последующие дни выношу рассаду днём, но также тщательно слежу за температурой воздуха, влажностью почвы, а на ночь заношу в теплицу, или накрываю парниковой плёнкой и оставляю на улице, только если температура не опускается ниже +8 градусов. Закаливаю рассаду в течении 10 дней, до пересадки томатов в парник.
Вы просто залили рассаду. Поливать нужно раз в три - четыре дня. Дно ёмкости должно иметь дырочку для стока лишней воды. Ну, или торфяные стаканчики подойдут. То, что я вижу на фото, уже не годится. И, самое главное, уберите рассаду на восточную сторону. Солнце должно быть утром. Обеденное солнце сожжет рассаду. Притените чем-нибудь, если убрать не получается. Повесьте на стекло кусок спанбонда. Он пропустит свет, но не солнечные лучи.
Обратите внимание на землю в горшке. Скорее всего или Вы заливаете свою рассаду или вода застаивается, что приводит к болезни саженца "чёрная ножка". Помидоры не любят длительного застоя воды в почве, им комфортнее, когда ком земли рыхлый и сухой. Поливы должны быть умеренными, только чтобы растение напилось. И ещё один момент, нельзя поливать холодной не отстоявшейся водой, тоже приводит к болезни корневой системы. Как исправить- срежьте низ, а верх поставте в воду со слабым раствором марганца, марганец обезвредит и когда саженец даст корень посадите его вновь. Сильно на потере урожая это не отразится, растение догонит крепкие саженцы позже в грунте и отдаст нормально урожай.
Огурцы и помидоры начинают гибнуть при температуре земли ниже 12 градусов, в теплицу рассаду помидор и огурцов высаживают, когда температура почвы достигнет + 15..+17 градусов, раньше высаживать очень рискованно, при более низкой температуре земли помидоры и огурцы просто перестанут расти, а если будет повышенная влажность , начнут гнить в корнях.