Такое, кстати, бывает и очень часто. Мне кажется, что в данном случае самое главное - это помнить о своих личных интересах и не забывать для чего Вы ходите на работу. В большинстве случаев - явно не для того, чтобы завести себе друзей и единомышленников.
Люди на работе зарабатывают деньги, профессионально самореализуются, иногда бывает, правда редко, что делают карьеру.
Скорее всего нелюбовь начальника возникла не на пустом месте, просто "из личной неприязни". А потому, что возможно Ваш начальник видит в работнике конкурента, какую-то помеху или просто он, таким образом самоутверждается и решает свои личные проблемы. Очень часто начальники не любят "сильных", умных и талантливых подчиненных, предпочитая всяких "серых мышей" и посредственностей, которыми легче управлять и на их фоне выглядеть Богом.
Потом, следует помнить, что ничто не вечно под луной и начальство тоже бывает сменяется и на его место приходит другой, даже если иногда кажется, что такого быть просто не может. Может, и очень даже часто.
Поэтому, тут главное правильно себя настроить, не принимать поведение и придирки начальства близко к сердцу и не обращать внимания, если это позволяет ситуация. Если начальник - не владелец, а всего лишь обычный наемный персонал, как и его подчиненный, и не имеет права принимать решений по увольнению - перемещению, то проблема не очень велика.
Просто работайте себе спокойно, выполняйте свою работу качественно и на высоком уровне, особенно если работа действительно очень нравится и оплачивается хорошо. А против начальника включите внутренний, невидимый психологический заслон. Ну примерно как от мухи или комара, которые могут докучать, но на них не обращают внимания и продолжают заниматься своими делами. Не реагируйте на выпады начальника вообще никак, живите как бы своей отдельной от него жизнью, насколько это позволяет ситуация.