На мой взгляд причина в том, что такие дети отличаются от остальной массы.
А те, кто похожи, то есть нормальные, а не странные, наоборот, сбиваются в кучки. Там у них есть самый задиристый и сильный, он же лидер и остальные, которые всецело его слушаются.
Им не нравится, что кто-то не похож на них, он другой, поэтому его будем обижать. То есть он, как-бы выделяется из толпы и сам нехотя того, привлекает к себе внимание других. Эти другие начинают думать, что этот мальчик какой-то особенный, не похож на остальных. Они могут высмеивать его, так как он ведет себя по-другому. А против толпы идти тяжело, особенно в столь юном возрасте. Он не может справиться с толпой. Он один. и поэтому, остальные чувствуют эту слабость и со временем парень может превратиться в изгоя, что оставит отпечаток на всю жизнь. Сам учился в школе, и у нас в классе был такой парень. Ему пришлось перевестись. Поэтому, как вариант можно рассматривать смену коллектива. Возможно, ему удастся влиться и в другой. Ну и конечно же нужен контроль учителей, дабы пресекать такие нападки на мальчика. Нужно проводить игры, конкурсы, которые наоборот будут способствовать сплочению коллектива.