Fat 32 на NTFS без потери данных сменить можно путем конвертации, вот хорошая программа для этого PartitionMagic 8.0, так же это можно сделать и штатными средствами Windows
вот утилита convert.exe
Запускается она из командной строки под правами администратора
CONVERT том: /FS:NTFS [/NoSecurity] [/X]
Здесь том - определяет букву диска (с последующим двоеточием)
/FS:NTFS - конечная файловая система: NTFS.
/NoSecurity - параметры безопасности для преобразуемых файлов и папок будут доступны для изменения всем.
/X - принудительное снятие этого тома (если он был подключен).
Все открытые дескрипторы этого тома станут недопустимыми.
Например, если требуется конвертировать диск C:,то
CONVERT C: /FS:NTFS /NoSecurity /X
Желательно перед этим проверить диск на наличие ошибок и помните, что если во время этой процедуры выключат свет, то все ваши данные пропадут.