Никаких хитрых настроек я не знаю. Конвертирую MKV в AVI при помощи хорошей программы: Jet Audio. Может быть так совпало, но ни разу после обработки видео данной программой проблем со звуком не было. Рекомендую.
Скачайте и установите универсальный набор кодеков K-Lite Codec Pack Full. В нем содержатся кодеки, необходимые для воспроизведения всех форматов видео-файлов и аудио-файлов. Скачать этот пакет кодеков можно с официального сайта здесь.
Если грубо, то в AVI (Audio Video Interleave) по очереди идут фреймы с видео и звуком только. Часто, из-за недостаточной производительности, звук может рассинхронизироватьс<wbr />я с видеорядом. "Матрешка" (MKV) такого не допускает, так же в "матрешку" можно вставлять синхронные субтитры и несколько звуковых дорожек на разных языках.
MKV более гибкий контейнер.
Видео и аудио может быть сжато любым кодеком и в "матрешке", и в AVI.
Конвертировать можно любым сторонним конвертером понимающим оба формата. Конверсия контейнера происходит без перекодирования.
В состав K-Lite Codec Pack входит проигрыватель видео Media Player Classic (MPC). После установки этого распространённого пакета кодеков нужно немного настроить этот плейер, если он не воспроизведёт файл данного формата: в разделе "Форматы" нужно будет поставить галочку напротив формата MKV, затем - нажать "Применить" и "ОК". У меня этот плейер воспроизводит MKV, хотя я предпочитаю что-то попроще: например, AVI.
Формат MP4 в основном рассчитан на мобильные устройства. Такие файлы позволяют содержать несколько потоков видео, субтитров, аудио и т.д. Такой формат идеален для мобильных устройств. Для воспроизведения на компьютере лучше выбрать формат MKV.
Формат MKV позволяет пользоваться практически всеми функциями ДВД. Может содержать видео, аудио на нескольких языках. Также данный формат может хранить в себе информацию о главах, меню... Из данного формата можно вытащить аудио-дорожки, видео без дополнительных редакторов.