Если охладительная система вашего компьютера расположена так, что установленный на ней кулер может дуть либо "в материнскую плату" или "от неё", то нужно установить кулер так, что бы он дул на материнскую плату.
Если охладительная система расположена так, что установленный на ней кулер может дуть "в заднюю стенку или "в переднюю" вашего корпуса, то нужно установить кулер, а соответственно и охладительную систему так, что бы куллер дул в заднюю стенку компьютера, на которой установлен кулер который выдувает воздух из корпуса. Соответственно воздух который будет дуть в охладительную систему, будет проходить через нее, а после будет подхватываться кулером установленным на задней стенке корпуса, и выходить "вон".
Если есть возможность установки 2 кулера на охладительную систему , то его нужно установить так, что бы он как бы высасывал воздух из охладительной системы а после направлял как кулер установленный на задней стенке корпуса. Так же в новых корпусах блок питания находиться снизу, что позволяет установить кулера на охладительной системе, и саму охладительную систему так, что бы она дула в верхнюю стенку корпуса, на которой в свою очередь установлен кулер который выдувает воздух из корпуса вверх. Но если у вас большая охладительная система, например скутхе нинджа v3. То вы сможете устоновить её только так, что бы поток воздуха дул на заднюю стенку, потому что видюха не позволит вам устоновить её по другому.. Вообщем нужно смотреть на конкретном примере.