Неприятные ароматические молекулы от собаки на мебели убирать надо быстро, чтобы они не впитались сильнее. Потому что поверхность пола нигде не рованая, поры, микропоры, трещинки, царапинки, туда все забивается и пахнет неслабо потом, хотя и лужа вытерта полностью досуха.
Берите уксус, лимонную кислоту, можно все вместе, соду, и этим шипящим заивайте, оставьте, потом еще потрите, и после того как смоете, еще лимоном потрите.
Собака любит метить углы? Попробуйте ей создать уголок-мини из гипсокартона, с кусочком так же и пола, обейте угол и пол хоть линолеумом, только гладким, чтобы было мыть проще, и поставьте туда, куда он чаще всего метит.
В лоток, раз речь о лотке, можно поставить деревце, ветки, мини-столб, который собака захочет метить. А вы ее хвалите за то, что сходила и пометила там!
А запах шерсти псинный никак не вывести, только мыть часто, но если собака сильно ароматная от породы и природы, этого на половину дня хватит.
Квартира же должна проветриватся как можно чаще, ставьте кондиционер, делайте влажную уборку, ароматизатор для дома автоматический поставьте.