В прямом смысле смотреть сквозь пальцы - это вроде как закрыть глаза рукой(кистью), но не плотно, расставив пальцы, и продолжать все видеть.
С одной стороны - глаза рукой закрыты. Но человек продолжает видеть, а значит, условие не соблюдено, и глаза не закрыты.
Смотреть сквозь пальцы - устойчивый оборот речи, означающий, что человек вроде бы знает, что что-то не верно, но допускает это, соглашается. Иногда данный оборот употребляют и в значении "вообще все равно", то есть персонаж даже не думает, что происходящее плохо, он просто на него смотрит "сквозь пальцы".
Примеры.
Для первого случая - Женщина сдавала квартиру семье с условием проживания без животных, но смотрела сквозь пальцы, когда те подобрали бездомного больного котенка и оставили его у себя.
Для второго случая - На уборку в доме веселые хозяева смотрели сквозь пальцы, что было, однако, неприятно их редким гостям.