Ну если марганцовка фиолетовая, а стекло коричневое, то могу предположить, что в результате получится тёмно-красный цвет.
В основном такие поделки в виде бутылок с отрезанным дном применяют вечером на даче и в своем доме - прикрывают свечу от задувания ветром на открытом воздухе. Свечка не гаснет, так как в открытом горлышке есть просвет, а сама бутылка тяжелая и не падает, да и пожаро безопасна.
Иногда делают даже люстры, патрон засовывают с проводом в разрезанную бутылку, а уж потом собирают всю конструкцию.
Такие "ночные фонарики" иногда расписывают, если бутылка была изначально прозрачной, или ищут из цветного стекла.
Но покупать ради этого спец машинку, по-моему лишняя трата денег. Умельцы уже давно режут такие бутылки крепкой промасленной ниткой: наматывают её в нужном месте и поджигают. Стекло нагреется только под ниткой и быстро опустив затем такую бутылку в ведро с ледяной водой, дно само отходит.
Ещё некоторые разбивают (или режут) такие цветные бутылки на кусочки и делают из них аппликацию на камне или каменной фигурке, края замазывая цементом или шпаклевкой, чтобы не порезаться. Получается на века.
В йодной настойке, кроме самого йода, содержатся также вода, этиловый спирт, йодид калия (он сильно повышает растворимость йода). Растворенный йод медленно реагирует со спиртом, при этом одном из продуктов может быть йодоформ CHI3. Причем на свету эта реакция сильно ускоряется. Поэтому йодную настойку хранят в склянках из темного стекла и рекомендуют держать ее в темноте.
Разница есть, не существенная. Например в стекло, из которого делают бутылки для вина добавляют оксид железа и оксид хрома. Самый дешевый способ получения дешёвого зеленого стекла. Оно абсолютно безвредно и может использоваться для пищевой посуды.
Раньше для получения красивых зеленых оттенков использовали уран, но решили, что вредно и отказались. Сейчас подобное ура новое стекло можно встретить только среди антиквариатных изделий.
Однозначно, в стеклянной таре. Стекло инертно к компонентам напитка, а значит, более экологично. Пластик, иначе - полимер. Как Вы должны помнить из курса школьной органической химии, при ряде условий, мономерные звенья способны отщепляться от громоздкой молекулы полимера. И могут вступать в реакции, в результате которых могут образоваться отнюдь не безобидные соединения.