Лучше всего УСН. Если вы собираетесь что-то покупать, а потом с наценкой перепродавать, то лучше всего Доходы минус расходы. 15 процентов с прибыли + страховые взносы на ИП, если ИП работает один. В учетной политике прописать, что метод начисления: кассовый. То есть доходы начисляются в момент поступления денежных средств. Для расчета с заказчиками и поставщиками открыть расчетный счет. Это избавит вас от необходимости покупать кассовый аппарат и оформлять его в налоговой.
Если ИП собирается нанимать официально сотрудников, то ко всему уплата с их заработной платы НДФЛ и страховых взносов в пенсионный фонд, Фонд социального страхования и Медицинский Фонд.
НДС при УСН не платят, так что если вам выставили счет с НДС, ИП включает эту сумму в расходы, а не возмещает, как при обычной системе налогообложения.
Ну, а остальное, в зависимости от того что будет продаваться в интернет-магазине.