Как правило, такой крепеж, под специальный инструмент, применяют в случаях, когда разборка связана с опасностью открытого устройства, сложностью самого устройства, наличия внутри критической юстировки (подстройки режимов), специальных условий для сборки, возможности утраты функционирования после разборки (пример - снятие платы контроллера на некоторых HDD) ... ну и другие подобные случаи. И это не считая желание производителя сохранить в секрете устройство своего изделия.
Отдельный случай - когда это обусловлено функциональностью такого крепежа - упрощение конвейерной сборки, более жесткое или качественное крепление, большая прочность соединения и подобное.
Но специалист, как правило, имеет набор соответствующего инструмента, как раз на такие случаи.
Немало примеров, когда пользователь разобрал устройство, получил удар током или даже просто испортил устройство "нечаянно нажав на черную штучку, которая криво стояла, как ему показалось". А в результате - судебные издержки производителю. "Оно ему надо"? :)) Поэтому, чтобы уменьшить риск таких "непроизводственных издержек", ставят специальный крепеж, чтобы потом отказать в гарантии клиенту или, уже в суде, сказать - "Мы сделали всё что смогли, и даже поставили специальные шурупы, чтобы пострадавший не смог жевать красивые разноцветные мягонькие проводки, находящиеся под напряжением 900 вольт".
Ну, а уж капитализм, который старается сделать из всего секрет и нажиться на этом, тот вовсю будет использовать "специальный крепеж под специальный инструмент".
Так что, в спецкрепеже есть и здравый смысл, и желание нажиться.