Всё очень точно рассчитывается! Если ракета летит на МКС, то учитывается орбита МКС и на основе этих данных строится самый экономичный маршрут к станции. Соответственно и ракета заправляется "в обрез", с очень небольшим запасом "на всякий случай".
Если ракета запускается в автономном режиме, "сама по себе, без стыковке с МКС, то смотрят на то, какие задачи у неё есть, составляется график исследований, с том, чтобы успеть сделать всё в наиболее сжатые сроки и с минимальными затратами топлива и энергии. Кстати, именно поэтому у космонавтов плотный график работ. Соответственно и время старта, также, рассчитывается под первую (или другую) задачу в этом графике. То есть, если определили, что первой задачей лучше сделать фотометрирование поверхности Луны (Земли, Марса и так далее), то старт рассчитывают с учетом движения Луны, так, чтобы после старта можно было сразу приступить к этой задаче, а Луна в это время находилась в оптимальной, для фотографирования, точке.
Добавлю. Скорость ракеты это несколько километров в секунду! Уже понятно, что ошибка +/- 1 секунда, это ошибка в позиции почти 10 километров на орбите!