Поможет только четкая, логичная иерархическая структура папок. Я делаю папки на диске Д: Видео, Установочные файлы, Аудио, Картинки, Фотографии, Игры, Текст, Карты, Торрент, Работа. Все программы устанавливаю в Програм файлз. Не стоит кстати переусердствовать с количеством папок и подпапок, двух-трех уровней вполне достаточно, за редкими исключениями.
Папка видео у меня правда практически всегда пустует, видео лежит на внешнем винчестере.
Фотографии намерянно выделены из "картинок" потому, что в картинках всё подряд большими кучами, а фотографии отсортированы по датам и событиям, точнее по категориям, затем по годам, а затем по событиям.
Аудио подразделяется на несколько папок по жанрам, затем группы, затем сами файлы.
Текст разделён на Аудиокниги (да, для некоторых это кажется нелогично, но у меня вот так), книги, интернет страницы и прочие тексты. Книги разделены на жанры.
Игры без сортировки, потому что я туда и не заглядываю, запуск идет с рабочего стола.
Карты - это связанно с работой и увлечениями одновременно, потому и в отдельной категории.
Торрент папку оставляю в таком виде, в каком её создает программа.
Ну и "работа" само собой тоже четко структурированна на "сделанное", "в процессе" и так далее.
Папки "всякое", "разное" или "разобрать" у меня нет, я стараюсь сразу впихивать приходящее как минимум в одну из папок первого уровня, без дальнейшего распихивания по более подробным категориям. Где-то раз в месяц, не чаще, я сажусь и несколько часов всё распихиваю по местам.
Думаю, кроме собственной аккуратности и организованности, ничего не поможет в правильной, логичной организации внутреннего пространства компьютера.