Балластные воды - это воды, которые являются вспомогательным грузом для удерживания судна на воде прямо, когда он к примеру пуст, и не погрузился на нужную ему глубину для хода.
Воду загружают там, куда приплыли, а это разные океаны и моря. И у них свои бактерии, вирусы, микробы. Природа одного края как и люди, привычна к тому, что живет в их воде. Привычны друг к другу, свой иммунитет. А когда вода привозится из одного места в другое, и выливается там же, то с водой и микроорганизмы с вирусами попадают в новую для них среду.
Это плохо и для людей, и для животных с растениями. Гибнет рыба, водоросли, люди могут заболеть чем-нибудь, купаясь и кушая мокрыми руками после плавания.
Поэтому отплыли, слили воду ту, которую брали, и набрали "своей". А более рационально - тратиться на механизмы, помогающие воду чистить и фильтровать, чтоб не было в ней ничего опасного. Что делают только те компании, у которых хватает денег.
А некоторые страны и вовсе законодательно внесли смену балласта в воде