Во время работы жёсткого диска его категорически не рекомендуется переворачивать, ставить на попа трясти и прочие дела. Абсолютно не важно какого он интерфейса. Если тряска будет значительной в СМАРТ-е увеличится значение в параметре атрибута № 191 "G-sensor Shock counter" (счётчик ударов).
Жёсткий диск, если он без корпуса, желательно уложить платой вверх. Любой конфигурации 2,5" или 3,5", ATA или SATA. Это даст ему лучшее охлаждение платы контроллера. Неплохо создать ему принудительное охлаждение, положив сверху на него пластиковый корпусной вентилятор.
В корпусе необходимо, чтобы все жёсткие диски обдувались входными вентиляторами. Не рекомендуется, чтобы температура ЖД или SSD превышала 40 - 45 градусов Цельсия. Это увеличит срок их службы в разы (для общего сведения)
Температуры моих дисков:
Резюме: если хотите перевернуть ЖД, прежде выключите его, дождитесь полной остановки (несколько секунд), потом переворачивайте
В моей практике был случай, когда один "герой" решил перевернуть винт 40 гиг Макстор, тот умер прямо у него в руках. Винт был на издыхании, гироскопический эффект добил его.