Согласно законам физики, практически любая совершающаяся работа сопровождается выделением тепла. И здесь не завит какая это работа, кто или что её выполняет, какие результаты и т.д..
Работа двигателя тоже подчиняется законам физики. И тоже при этой работе происходит выделение тепла. Где-то больше, где-то меньше. Где-то и в каких-тотусловиях это тепло нужно отводить принудительно,- для избежания перегрева и как результат выхода из строя. В другом случае этот теплоотвод производится естественным путём, а в третьем вообще может быть настолько минимален, что и перегревом не считаться не будет.
Я не знаю какой именно двигатель имел ввиду автор вопроса, но примеров приведу двигатель автомобиля,- ДВС, двигатель внутреннего сгорания.
В ДВС основой ротзводства работы является горючее топливо и принцип получения энергии от его сгорания. Уже одно только слово "сгорание" говорит само за себя. Топливо, сгорает в цилиндрах двигателя, при горении конечно же повышается температура цилиндров, тепло передаётся по теплопроводными материалам, что помимо самих цилиндров нагревает ещё и близлежащие узлы, агрегаты и неподвижные части самого двигателя. Так же в ДВС есть агрегаты, и узлы, при работе которых выделяется тепло от другого физического явления,- трения. И хотя конструктивные особенности ДВС предусматривают снижение этого трения за счёт смазки, полностью от него не избавиться никогда и тепло всё равно выделяться будет.
Вот собственно и естьте самые причины, из-за которых и происходит нагревание двигателя автомобиля.
В двигателях с другой системой работы тоже присутствует факт нагрева, но здесь сходной с ДВС является только причина - наличие трения. Но помимо этого есть и другие причины, у каждой системы свои, основанные именно на конструктивных её особенностях.