Только что разве нелегально. Или на уровне криминала "на паях с государством". Легально то это только в перестройку было можно сделать. Все остальное -чревато плотной работой с ОБХСС. А это большие затраты и страх "спалиться".
Ответ очень простой.
Без этих республик, при прочих известных обстоятельствах, СССР прекратил бы существование к началу 1942 года. Незадолго до новогодних праздников началось бы обустройство новой германо-японской границы по Уралу.
Как известно, в Ленинграде было сосредоточено около 1/3 всей промышленности СССР. По тяжёлой и оборонной - так и поболее будет. В этом сценарии её захватывают (или в "лучшем" случае) наглухо блокируют в первые 10 - 12 дней боевых действий.
Ну ладно, часть предприятий заранее или же в пожарном порядке перебросили на восток. Но танки, самолёты, корабли и грузовики заправлять нечем. Вся нефть-то в Баку. На 2 - 3 недели накоплено импортных запасов и сберегаемых резервов. А потом... А потом останутся только мечущиеся в панике туда и сюда жалкие остатки пехоты, тающие под ударами танков, артиллерии и авиации противника, как эскимо в пустыне в полдень!
Не думаю, что общий характер войны существенным образом бы изменился. Указанные в вопросе территории немецкие войска прошли достаточно быстро. В частности, на Северо-западе первые серьезные проблемы у немецких войск возникли только на Лужском оборонительном рубеже. Так что, хотя нужно уважать любые, даже маленькие территории, в данном случае никакого серьёзного влияние на ход Великой Отечественной войны наличие или отсутствие данных территорий в составе Советского Союза не отказало бы. А нюансах можно только гадать. Например, наличие в составе СССР той же Прибалтики позволило выиграть немного времени, но с другой стороны при защите этих рубежей было большое количества жертв. A переход кораблей Балтийского флота из Таллина в Кронштадт сопровождался большими потерями.
В во времена СССР и сейчас самая известная прибалтийская певица - Это Лайма Вайкуле. Анне Веске появлялась на сцене и во времена СССР и в наше время. Помню еще Мирдзу Зивере, она исполняла песни Раймонда Паулса, помню ее Листья желтые, сейчас давно про нее не слышала. Пожалуй и все популярные певицы, о которых я знаю.
Скорее всего это были межнациональные конфликты в Фергане, Оше (Киргизия), Карабахе и Тбилиси. А в августе 1969 пограничный конфликт на китайской границе в районе озера Жаланашколь на территории Казахстана.