Вы сами ответили на свой вопрос. Вера в Бога - это духовное знание и готовность к жертвенности, в то время как вера в душе - это эмоциональное переживание с заранее заданными параметрами. В понимании Библии человек это дух, душа и тело.
Дух это то что нам даётся Богом, это та суть которая связывает нас с Ним (при этом не имеет значения верим мы в Него или нет), потому и сказано: "И возвратится прах в землю, чем он и был; а дух возвратится к Богу, Который дал его" (Еккл.12:7). Имея дух от Бога мы испытываем потребность общения с Ним, ведь мы созданы по Его образу и подобию.
Душа же необходима нам в этом мире - это наш ум, знания, желания, переживания, опыт и т.д. Имея душу мы можем любить и наслаждаться жизнью или же наоборот ненавидеть всех и вся и тяготится бременем жизни. Душа тесно переплетена с телом и возможно погибает вместе с ним, т.к душа (возможно) это продукт химических процессов нашего организма. Звучит не очень романтично, но что поделать.
Когда душевные терзания, помыслы и желания преобладают в человеке - он не думает о Боге, он думает о комфорте и благополучии здесь и сейчас. Но каждый человек, который выходил за пределы потребительства начинает понимать - всё не так просто как кажется. Особенно остро это чувствуется в период нужды, болезней, приближения старости и как следствие - смерти. Что дальше? Никто не знает. И потому некоторые подстраховываются и начинают верить в душе. Вера в душе, это вера в которой верующий сам задаёт правила игры, его вера универсальна и гибка, в зависимости от потребностей верующего. Иначе обстоят дела с верой в Бога, о которой ниже.
Преимущество веры в Бога (в отличии от веры в душе), т.е духовной близости верующего с Богом, в том, что он как бы встаёт над этими стихиями, которые владеют нами в этом мире. Он видит иначе важность того или иного события, у него другое мировоззрение, он старается нести в этот мир благо и добро, потому что подражает Богу, который заповедовал это, ведь Бог есть любовь. Наконец, он обретает умиротворение, потому что научился отсекать суетные дела от важных. Эта вера созидательная, она меняет человека в лучшую сторону, даже когда человек противится этому.