Сама Алиса Гессен-Дармштадтская, как правильно люди уже написали, гемофилией не болела. Она была носительницей гена по линии своей бабки королевы Виктории.
Но ген гемофилии проявился только у потомков королевы, никто из её предков (а проследили на несколько столетий назад) гемофиликом не был. То есть либо отцом Виктории был не герцог Кентский, либо случилась редчайшая генная мутация. То есть до того, как у нескольких потомков Виктории обнаружились проявления гемофилии, никто в королевском доме об этом заболевании даже не думал и не боялся.
Первый из королевской семьи, у кого была обнаружена болезнь, принц Леопольд, сын Виктории. Он прожил 30 лет, умер в 1884 году. Остальные три сына Виктории гемофиликами не были, прожили долго, один даже до 91 года. Поэтому семейство и представить не могло, что болезнь проявит себя в потомках по женской линии, а болезнь Леопольда посчитали случайностью.
В то время о гемофилии уже было известно, но о генах, о наследственных заболеваниях ещё ничего не знали. Мендель ещё только-только успел свои работы опубликовать, и к ним мало кто серьёзно отнёсся.
Кроме Леопольда, к моменту помолвки Николая и Алисы было известно о гемофилии у родного брата Алисы Фридриха (он умер в два года после того, как выпал из окна), у принца Вальдемара Прусского, правнука Виктории, и у Леопольда, внука Виктории, сына принцессы Беатрисы. Но Вальдемар и Леопольд были ещё совсем маленькими, и родители, думаю, не трубили на весь свет об их болезни. Хотя Алиса должна была знать о гемофилии Вальдемара - он был её родным племянником.
Таким образом, сама Алиса знала, что в её семье есть больные гемофилией - дядя Леопольд, брат Фридрих и племянник Вальдемар. Но так как женщины не болеют, предположить, что она сама носит ген гемофилии, Алиса не могла. Не было тогда понятия наследственное заболевание, носитель гена и т.п. Кроме того, ген ведь передаётся не всегда, многие мужчины из потомков Виктории гемофилией не болели, многие женщины носительницами не были.
А уж тем более Николай и подумать не мог, что по линии Александры Фёдоровны может передаться такое страшное заболевание, которое погубит не только его самого и его семью, но и всю империю.