Пересмотрев в Википедии статью "Список ядовитых растений", отмечу, что есть в современных аптеках из списка:
Полынь, горчица, крапива, золототысячник, багульник, хвощ, пижма.
Хотя это сырье продается без рецепта, к списку "А" (яды) не относится.
Некоторые поступают на фармацевтические заводы и фабрики:
красавка, аралия, ландыш, наперстянка, термопсис, чемерица...
Издавна используются тропические ядовитые растения строфант (семя) и стрельный яд индейцев кураре.
Раньше ядовитые растения более широко использовались.
Аптеки готовили отвары, настои и сборы, занимались заготовкой лекарственных растений.
Были аптекарские огороды, совхозы по выращиванию лекрастений.
И в прописях Средневековья были, потому что не было современных лекарственных препаратов.
Народной медицины и немедицинского использования не касаюсь - мне известно, что белену, дурман, мухоморы употребляют, и марихуану(конопля), и опий или маковую соломку.