Это точно не из-за мусора на объективе. Он просто не попадает в область резкости, а если и проявляется, то иначе. Линза видоискателя влияет на изображение в видоискателе, а не на снимок. Там вообще просто разобраться. Как и с тем, куда же именно (в смысле, в какой датчик) камера фокусируется - это же видно, активные датчики подсвечиваются в видоискателе.
Вижу в комментариях, что проблемы начинаются в условиях недостаточной освещённости. Это объяснимо. Датчику фокусировки просто не хватает света. Это происходит или когда вокруг темно, или когда диафрагма слишком закрыта. Обе причины имеют свойство складываться.
Но, поскольку та же проблема проявилась и на другой камере, стоит внимательнее присмотреться к объективу. Бывают такие проблемы, как фронт- и бэк-фокус, то есть постоянное смещение наводки туда или сюда от точки прицеливания. Можно найти в интернете шаблон таблицы, установить под углом 45 градусов, осветить, камеру на штатив и... Проще отнести в сервис. Такие вещи порой выявляются у целых выпусков объективов. Мол, модель такая-то такого-то производителя обычно целится мимо, так что при покупке, если всё же решитесь именно на эту, придётся перебрать штук десять - пишут на форумах. Насчёт Nikkor 18-105 ничего сказать не могу (работаю на другой системе), но на ленсклубе пользователи отмечают, что при низкой освещённости он теряется и что он требует коррекции фокусировки в "тушке", то есть в самой камере. Не знаю, как там у Никонов, залезьте поглубже в меню, может и найдёте. Если в вашей камере такое есть. На худой конец остаётся юстировка в сервисе.