Если в смысле функционала (сиречь - исполнения профессиональных действий) - ничем.
Правда, нынче в авиационной среде любят порассуждать на тему:
Дескать "пилот", это авиатор, который может летать без автопилотов и прочей электроники где угодно и в пределах прямого видения, а "летчик" - только по "набитым трассам", как осёл у колодца или шахтный пони в руднике.
Но, это так, спесь и понты.
Сами же слова - различны.
Пилот - заимствованное, лётчик - отечественное изобретение.
Хотя, мое субъективное мнение, доля истины в квалификационных рассуждалках - имеет место быть.