Мотив — это причина, повод, то, что побудило что-либо сделать или принять решение.
Слово «существенный» несёт в себе несколько смыслов от «имеющийся в реальности, на самом деле» до «ценный, истинный, важный». Но в данном случае это явно ближе к последнему — «имеющий важное значение, первостепенный».
Следовательно утверждение «мотивы несущественны» означает, что причины поступка (решения) неважны и не имеют значения.
Использовать это выражение можно в случае, если для какого-либо действия мотив, то есть повод, побудительная причина поступить именно так, а не иначе, значения не имеет или может не приниматься во внимание, например, в силу слишком серьезных негативных последствий или неприемлимости вообще (из-за несоответствия закону, морали или мировоззрению в целом).
Как правило, применяется журналистами, блоггерами, в обсуждениях.
Например, при обсуждении в сети социального эксперимента неких брянских блоггеров, которые разыграли похищение ребёнка, комментаторы указывали на неприемлимость их поступка как со стороны закона, так и с точки зрения этики, используя фразу:
имея в виду, что состав преступления «похищение» имеется, и с точки зрения последствий для ребёнка (стресс, испуг и тому подобное) причина поступка («проведение социального эксперимента», «шутка») в данном случае значения не имеет.
К слову, далеко не всегда мотивы могут быть признаны несущественными именно в негативном ключе. Это может быть и простая константация их неважности для обсуждаемой группы людей (человека). Например:
В данном случае имеется в виду, что уровень заработной платы (экономический мотив) для выбора работы не принимается во внимание, не является первостепенным по важности. На первый план выходит что-то иное (доступность, близость к жилью, удобный график и тому подобное).