Мать Софии Палеолог, Екатерина, из генуэзского рода Дзаккариа. Дед и отец Екатерины правили в Ахейе. Вышла замуж за Фому Палеолог, морейского деспота. Братья Фомы, Иоанн VIII, Константин XI, это последние Византийские императоры. С гибелью последнего, Фома Ветхословец считался легитимным императором погибающей империи.
Соответственно, Зоя Палеолог (имя при рождении), являлась византийской принцессой.
Семье пришлось от турков бежать на Корфу. Оттуда Фома отправился в Рим, принял католичество. Екатерина с тремя младшими детьми (Андреем, Мануилом, Зоей) осталась на острове. В 1465 Екатерина умерла, отец перевёз детей в Рим и сам умер вскоре.
Воспитывать детей папа Сикст IV поручил Виссариону Никейскому, перекрестившего их в католиков.
Так крещёная в православии Зоя Палеолог стала католичкой Софьей Палеолог.
Папа Римский, узнав, что Иван III овдовел, отправил послов на Русь, предложив Софию в качестве невесты. Цель была, чтобы католичка София повлияла на мужа, склонила Великого князя к католичеству и всю Русь к Флорентийской унии.
Великокняжеские послы, однако, поговорив с Софией, убедились, что православие религия её родителей, а окатоличили её не спросясь, по малолетству.
Выехав со свадебным поездом из Италии, Зоя Палеологиня молиться начала по-православному.
"Царегородская принцесса", византийская наследница, придала легитимность "переноса империи" из Константинополя, ставшего мусульманским Стамбулом, к Руси. Так возникла идея "Третий Рим" как религиозно-историософская и политическая идея "translatio imperii".
Здесь ещё о Палеологине.