Скажем так, Ваш вопрос слегка необъятен. Поэтому я возьму за основу Википедию как источник самой базовой информации, от которой можно будет отталкиваться для дальнейшего развития.
"Шапочки" и прочие знаки.
Из греческого в церковнославянский язык перешла постановка ударений. Поэтому поэтому в каждом слове какая-нибудь "клякочка" да висит. После падения Константинополя и с утверждением концепции "Москва - Третий Рим" в оформлении текстов возобладала нарочитая орнаментальность и порой совершенно бессмысленное украшательство, в том числе и букв. В текстах этого периода мы встречаем постановку ударений и диакритических знаков "для красоты", просто потому, что такие же "клякочки" часты в греческих текстах. Никакой иной функции, кроме декоративной, у этих знаков нет, а чтение они затрудняют.
Титло, мы до сих пор пользуемся чем-то подобным, когда пишем чёрточку в середине слова, например: "ис-во" вместо "искусство", что часто бывает в сту-ких к-тах.
Лигатура, то есть соединения двух букв в одну. То, что может показаться "шапочкой", часто является либо буквой омега титлом, либо лигатурой омега + тврьдѻ (от)
"Странные буквы".
Кириллица изменялась с течением веков. Некоторые буквы использовались лишь для обозначения цифр, другие исчезли очень рано из обращения, третьи изменили звучание.
Обозначение цифр - вообще цирк с современной точки зрения. Для них использовались буквы, над которыми стояли титла. Для обозначений тысяч к обозначению цифр первого десятка пририсовывали справа снизу "вошку с лапками" ҂, не говоря уже об особых знаках, которые использовались лишь для обозначения чисел. Выносящие мозг подробности - здесь.
И когда возьмётесь вычислять год, то не забудьте, что в допетровскую эпоху летоисчисление шло "от сотворения мира", причём год начинался 1 сентября.
Для примера взят фрагмент с третьей фотографии, там, где в лучах солнца написано имя Бога по-еврейски:
Текст получается такой:
Здесь нужно ко многому привыкнуть. Процесс этот трудоёмкий, но посильный.
Успехов!