Я рискну высказать предположение, что вам досталась либо фальшивая грунтовка(поддельная<wbr />), либо с неправильными условиями хранения. В таком случае она все равно что просроченная. Таких с неправильным хранением много на каких-то оптовых рынках. Она в результате либо прокисает, либо тухнет и тогда от нее при соединении с водой постепенно начинает идти запах аммиака. Или еще бывает тухлого яйца. Если грунтовка паленая, то вообще неизвестно чем ее разбавляли. Обычно запахи разворачиваются не сразу, когда начинается увлажнение. Иногда на 2-й день покраски концентрация достигает уже сильного запаха.
Причиной еще может быть, что мастер не до конца размыл потолок от старого покрытия и оно химическую реакцию начало давать непредвиденную. Тем более, что если была протечка, то скорее всего там еще и грибок завелся. Частично влажность может держаться очень долгое время после протечек, если расстояния между вашим потолком и полом соседей позволяют. Особенно, если плиты потолочные пригнаны не идеально. Представьте себе, что там эта вода тухла, потом постепенно просохла. Но то, что давало тухлый запах - это и бактерии и плесень, все в высушенном виде осталось. Если такие места смочить водой, они дают запах, будто вчера протухли.
Тут можно долго гадать.
Я б на вашем месте сделал 2 вещи. Это для начала сходил бы к соседям, рассказал ситуацию и спросил, не ощущали они постороннего запаха, приложился б к полу, в тех местах, где у вас особенно пахнет. Может быть у них вообще какая-то неучтенная перепланировка и от кухни взята часть площади на расширение санузла.
Если у них все нормально, то сделал бы соскоб в месте наибольшего запаха, отнес бы в химическую лабораторию.
Там определят, что у вас за вещества образовались и тогда они же могут посоветовать, каким веществом нейтрализовать эти запахи.