Каким бы ни был материал бутылки, он все равно имеет определенный запах и входит в реакцию с водой. Это не такая скоротечная реакция, как на уроках химии, и все же она есть.
Благодаря ей и происходит изменение вкуса.
Думаю, если взять бутылки из стекла, пластика и металла, то во всех трех одна и та же вода со временем станет разного вкуса.
И когда запах еды меняется, меняются и ее вкусовые качества, т.к. полноценный вкус мы как раз с помощью аромата и ощущаем.
Ко всему прочему в этом вопросе может быть еще и психологический момент. Существуют разные исследования, показывающие важность того, из какой посуды мы едим. И в зависимости от цвета, формы, размера, материала и других параметров одна и та же пища может в одной посуде казаться вкуснее, а в другой - не такой уж вкусной.