Для этого в таблицах символов существуют специальные символы Combining - символы для совмещения. Они отображаются на одном месте на экране.
В ОС семейства Linux такое совмещение делается легко и просто:
Достаточно в свойствах клавиатуры назначить клавишу compose. Я у себя сделал такой правую кнопку Ctrl, ибо ей не пользуюсь. Теперь для постановки ударения мне достаточно последовательно ввести правая Ctrl → символ → '.
По умолчании ударение поставится при английской раскладке клавиатуры. Но всегда можно отредакировать файл конфигурации клавиши compose и все эти вкусняшки будут срабатывать и для любой другой.
Кстати, стрелочки вправо сделаны правая Ctr → - → ю вместо правая Ctr → - → >.
В Windows несколько сложнее, но не смертельно:
Здесь, как и в любой другой ОС, можно воспользоваться таблицей символов. Шеснадцатеричные коды обра́̀тного и прямо́го ударения соответственно 300 и 301.
Но вот более простой универсальный выход из положения для Windows особенно. Просто копипастите из этого набора нужные:
о́ а́ е́ и́ у́ ы́ э́ ю́ я́
И вставляете, куда требуется. Не пугайтесь, что в поле ввода на БВ ударение ставится над следующим символом. Отображается в результате нормально.